Centrul European de Excelență pentru Mediu (ECEE), funcționează în cadrul Facultății de Științe și Mediu, Departamentul de Chimie, Fizică și Mediu. Centrul a fost înființat în anul 1999, sub denumirea de Departamentul Inter-Mediu, fiind susținut financiar de guvernul olandez (Programul Matra RO / 97/04). În anul 2001, ca urmare a unui concurs riguros organizat de Uniunea Europeană (programul PHARE RO 9706.01.02), Departamentul Inter-Mediu al Universității "Dunarea de Jos" din Galați a fost clasificat drept Centrul European de Excelență pentru Mediu (ECEE), devenind astfel singurul centru românesc clasificat ca atare de către Uniunea Europeană.
Corespondența activității CDI desfășurată de centrul ECCE cu domeniile de specializare inteligentă pentru ciclul strategic 2014-2020:
- Energie, mediu şi schimbări climatice;
- Eco-nanotehnologii şi materiale avansate;
- Sănătate;
- Patrimoniu și identitate culturală.